Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb2P0C1T1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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