Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa9P09631 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxa9P09631 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxa9P09631 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa9P09631 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa9P09631 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa9P09631 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa9P09631 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa9P09631 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa9P09631 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms