Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc8P09025 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms