Protein–RNA interactions for Protein: P08228

Sod1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod1P08228 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sod1P08228 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sod1P08228 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sod1P08228 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sod1P08228 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sod1P08228 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sod1P08228 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sod1P08228 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms