Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Me1P06801 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Me1P06801 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Me1P06801 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Me1P06801 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Me1P06801 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Me1P06801 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Me1P06801 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Me1P06801 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Me1P06801 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Me1P06801 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Me1P06801 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Me1P06801 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Me1P06801 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Me1P06801 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Me1P06801 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Me1P06801 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Me1P06801 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Me1P06801 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Me1P06801 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Me1P06801 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Me1P06801 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Me1P06801 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Me1P06801 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Me1P06801 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Me1P06801 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Me1P06801 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Me1P06801 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Me1P06801 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Me1P06801 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Me1P06801 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Me1P06801 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Me1P06801 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Me1P06801 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Me1P06801 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Me1P06801 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Me1P06801 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Me1P06801 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Me1P06801 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Me1P06801 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Me1P06801 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Me1P06801 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Me1P06801 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Me1P06801 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Me1P06801 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Me1P06801 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Me1P06801 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Me1P06801 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Me1P06801 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Me1P06801 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Me1P06801 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Me1P06801 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Me1P06801 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Me1P06801 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Me1P06801 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Me1P06801 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Me1P06801 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Me1P06801 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Me1P06801 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Me1P06801 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Me1P06801 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Me1P06801 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Me1P06801 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Me1P06801 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Me1P06801 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Me1P06801 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Me1P06801 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms