Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06344 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06344 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06344 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06344 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06344 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06344 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06344 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06344 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06344 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06344 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06344 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06344 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P06344 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06344 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06344 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06344 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06344 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06344 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06344 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P06344 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06344 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06344 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06344 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06344 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06344 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06344 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06344 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06344 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06344 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06344 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06344 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P06344 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06344 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06344 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06344 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06344 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06344 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06344 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06344 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms