Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06336 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06336 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06336 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06336 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P06336 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06336 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06336 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06336 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06336 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06336 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06336 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06336 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P06336 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06336 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06336 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06336 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06336 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06336 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06336 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06336 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P06336 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06336 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06336 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms