Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P04214 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P04214 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04214 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04214 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04214 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04214 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04214 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04214 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04214 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04214 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04214 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04214 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04214 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04214 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04214 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04214 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04214 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04214 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P04214 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P04214 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04214 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04214 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04214 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04214 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P04214 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04214 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04214 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04214 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04214 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04214 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04214 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04214 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P04214 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04214 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04214 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04214 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04214 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04214 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P04214 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04214 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04214 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04214 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04214 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04214 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04214 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04214 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04214 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04214 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04214 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04214 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04214 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P04214 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04214 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04214 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04214 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04214 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04214 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04214 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04214 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P04214 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04214 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04214 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P04214 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms