Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-Ab1P01921 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-Ab1P01921 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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H2-Ab1P01921 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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H2-Ab1P01921 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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H2-Ab1P01921 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Ab1P01921 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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H2-Ab1P01921 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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H2-Ab1P01921 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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