Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01852 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01852 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01852 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01852 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01852 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01852 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01852 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01852 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01852 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01852 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01852 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01852 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01852 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01852 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01852 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01852 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01852 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01852 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01852 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01852 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01852 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01852 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01852 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01852 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01852 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms