Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01746 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01746 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01746 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01746 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01746 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01746 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01746 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01746 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01746 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01746 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01746 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01746 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01746 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01746 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01746 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01746 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01746 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01746 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01746 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01746 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01746 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms