Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01735 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01735 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01735 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01735 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01735 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01735 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01735 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01735 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01735 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01735 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01735 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01735 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01735 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01735 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01735 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01735 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01735 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01735 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01735 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01735 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01735 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01735 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01735 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01735 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01735 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01735 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01735 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01735 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01735 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01735 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01735 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01735 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01735 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01735 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01735 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01735 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01735 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01735 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01735 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01735 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01735 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01735 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01735 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01735 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01735 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01735 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01735 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01735 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01735 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01735 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01735 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01735 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms