Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01655 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01655 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01655 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01655 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01655 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01655 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01655 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01655 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01655 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01655 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01655 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01655 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01655 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01655 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01655 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01655 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01655 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01655 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01655 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01655 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01655 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01655 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01655 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01655 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms