Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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P01649 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01649 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01649 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01649 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01649 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01649 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01649 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01649 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01649 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01649 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01649 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01649 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01649 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01649 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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P01649 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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P01649 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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P01649 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01649 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01649 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01649 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01649 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01649 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01649 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01649 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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P01649 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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P01649 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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P01649 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01649 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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P01649 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01649 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01649 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01649 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01649 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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P01649 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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P01649 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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P01649 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01649 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01649 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01649 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01649 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01649 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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P01649 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01649 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01649 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01649 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01649 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms