Protein–RNA interactions for Protein: P01634

Ig kappa chain V-V region MOPC 21, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01634 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01634 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01634 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01634 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01634 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01634 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01634 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01634 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01634 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01634 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01634 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01634 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01634 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01634 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01634 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01634 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01634 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01634 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01634 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01634 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01634 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01634 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01634 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01634 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01634 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01634 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01634 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01634 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01634 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01634 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01634 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01634 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01634 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01634 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01634 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms