Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igk-V19-17P01633 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms