Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casp8O89110 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casp8O89110 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms