Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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