Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcn2O88703 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms