Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capns1O88456 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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