Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AurkcO88445 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AurkcO88445 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms