Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AvilO88398 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AvilO88398 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AvilO88398 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AvilO88398 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AvilO88398 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AvilO88398 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AvilO88398 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AvilO88398 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AvilO88398 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AvilO88398 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
AvilO88398 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AvilO88398 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AvilO88398 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AvilO88398 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AvilO88398 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AvilO88398 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AvilO88398 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AvilO88398 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AvilO88398 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AvilO88398 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
AvilO88398 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AvilO88398 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AvilO88398 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AvilO88398 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AvilO88398 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AvilO88398 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AvilO88398 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AvilO88398 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
AvilO88398 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AvilO88398 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AvilO88398 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AvilO88398 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AvilO88398 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AvilO88398 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AvilO88398 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AvilO88398 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AvilO88398 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AvilO88398 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AvilO88398 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AvilO88398 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AvilO88398 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AvilO88398 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AvilO88398 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms