Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnt1O88346 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms