Protein–RNA interactions for Protein: O88319

Ntsr1, Neurotensin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntsr1O88319 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ntsr1O88319 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms