Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaskO70589 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaskO70589 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaskO70589 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaskO70589 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaskO70589 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaskO70589 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaskO70589 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaskO70589 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaskO70589 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaskO70589 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaskO70589 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaskO70589 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaskO70589 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaskO70589 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaskO70589 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaskO70589 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CaskO70589 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CaskO70589 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CaskO70589 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CaskO70589 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaskO70589 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaskO70589 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaskO70589 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaskO70589 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaskO70589 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaskO70589 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaskO70589 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaskO70589 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CaskO70589 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms