Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1O70583 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1O70583 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid1O70583 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid1O70583 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1O70583 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mid1O70583 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms