Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp4O70480 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms