Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtssO70370 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtssO70370 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtssO70370 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtssO70370 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtssO70370 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtssO70370 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtssO70370 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtssO70370 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtssO70370 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CtssO70370 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CtssO70370 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtssO70370 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtssO70370 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtssO70370 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtssO70370 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtssO70370 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtssO70370 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtssO70370 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtssO70370 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtssO70370 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtssO70370 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtssO70370 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtssO70370 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtssO70370 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtssO70370 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtssO70370 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtssO70370 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms