Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb5O70309 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb5O70309 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb5O70309 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb5O70309 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms