Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChkbO55229 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChkbO55229 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChkbO55229 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms