Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a2O55143 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms