Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrxO55103 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrxO55103 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrxO55103 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrxO55103 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrxO55103 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrxO55103 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PrxO55103 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PrxO55103 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrxO55103 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrxO55103 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrxO55103 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrxO55103 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrxO55103 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrxO55103 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrxO55103 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrxO55103 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrxO55103 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PrxO55103 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrxO55103 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrxO55103 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrxO55103 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrxO55103 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrxO55103 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrxO55103 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrxO55103 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrxO55103 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrxO55103 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrxO55103 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrxO55103 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrxO55103 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrxO55103 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrxO55103 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrxO55103 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrxO55103 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrxO55103 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrxO55103 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrxO55103 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrxO55103 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PrxO55103 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrxO55103 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrxO55103 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrxO55103 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrxO55103 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrxO55103 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrxO55103 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrxO55103 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrxO55103 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PrxO55103 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PrxO55103 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrxO55103 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrxO55103 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrxO55103 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrxO55103 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PrxO55103 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrxO55103 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrxO55103 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrxO55103 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrxO55103 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrxO55103 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrxO55103 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrxO55103 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrxO55103 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrxO55103 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrxO55103 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrxO55103 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrxO55103 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PrxO55103 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrxO55103 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrxO55103 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrxO55103 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrxO55103 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrxO55103 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrxO55103 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrxO55103 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrxO55103 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrxO55103 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrxO55103 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrxO55103 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrxO55103 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrxO55103 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrxO55103 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrxO55103 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrxO55103 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrxO55103 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrxO55103 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrxO55103 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrxO55103 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrxO55103 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrxO55103 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrxO55103 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PrxO55103 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrxO55103 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrxO55103 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrxO55103 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PrxO55103 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrxO55103 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrxO55103 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrxO55103 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrxO55103 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms