Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syngr2O55101 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms