Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copb2O55029 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copb2O55029 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copb2O55029 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copb2O55029 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copb2O55029 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copb2O55029 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copb2O55029 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copb2O55029 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copb2O55029 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copb2O55029 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms