Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LatO54957 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LatO54957 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LatO54957 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LatO54957 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LatO54957 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LatO54957 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LatO54957 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LatO54957 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LatO54957 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LatO54957 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LatO54957 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LatO54957 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LatO54957 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LatO54957 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LatO54957 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LatO54957 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LatO54957 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LatO54957 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LatO54957 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LatO54957 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LatO54957 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LatO54957 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LatO54957 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LatO54957 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LatO54957 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LatO54957 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LatO54957 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LatO54957 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LatO54957 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LatO54957 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LatO54957 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LatO54957 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LatO54957 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms