Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rdh16O54909 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16O54909 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16O54909 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16O54909 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16O54909 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rdh16O54909 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16O54909 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16O54909 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16O54909 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16O54909 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16O54909 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh16O54909 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rdh16O54909 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rdh16O54909 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rdh16O54909 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rdh16O54909 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rdh16O54909 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rdh16O54909 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rdh16O54909 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rdh16O54909 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rdh16O54909 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rdh16O54909 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rdh16O54909 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rdh16O54909 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rdh16O54909 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rdh16O54909 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16O54909 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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