Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3O54890 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3O54890 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms