Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms