Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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