Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms