Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clk2O35491 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clk2O35491 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clk2O35491 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk2O35491 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk2O35491 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk2O35491 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk2O35491 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk2O35491 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk2O35491 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk2O35491 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clk2O35491 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms