Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C1dO35473 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1dO35473 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1dO35473 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1dO35473 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1dO35473 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1dO35473 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1dO35473 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1dO35473 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1dO35473 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1dO35473 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1dO35473 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1dO35473 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1dO35473 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1dO35473 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1dO35473 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C1dO35473 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1dO35473 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1dO35473 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1dO35473 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1dO35473 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1dO35473 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1dO35473 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1dO35473 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1dO35473 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms