Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms