Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kpna3O35344 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms