Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kpna4O35343 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms