Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d1bO35324 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d1bO35324 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms