Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Polr1aO35134 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms