Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra3O35118 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra3O35118 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra3O35118 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra3O35118 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra3O35118 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra3O35118 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra3O35118 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra3O35118 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra3O35118 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra3O35118 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra3O35118 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra3O35118 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra3O35118 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gfra3O35118 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra3O35118 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra3O35118 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra3O35118 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra3O35118 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra3O35118 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra3O35118 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra3O35118 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra3O35118 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gfra3O35118 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra3O35118 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra3O35118 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra3O35118 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms