Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms