Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif1cO35071 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif1cO35071 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif1cO35071 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif1cO35071 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif1cO35071 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif1cO35071 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif1cO35071 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif1cO35071 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif1cO35071 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif1cO35071 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif1cO35071 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif1cO35071 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif1cO35071 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif1cO35071 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms